Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms