Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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USP53Q70EK8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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USP53Q70EK8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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USP53Q70EK8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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USP53Q70EK8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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USP53Q70EK8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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USP53Q70EK8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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USP53Q70EK8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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USP53Q70EK8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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USP53Q70EK8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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USP53Q70EK8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP53Q70EK8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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