Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU65

UBN2, Ubinuclein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN2Q6ZU65 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBN2Q6ZU65 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN2Q6ZU65 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms