Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD6Q6ZSS7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD6Q6ZSS7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD6Q6ZSS7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD6Q6ZSS7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD6Q6ZSS7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD6Q6ZSS7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD6Q6ZSS7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD6Q6ZSS7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD6Q6ZSS7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD6Q6ZSS7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD6Q6ZSS7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD6Q6ZSS7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms