Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC73Q6ZRK6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms