Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms