Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms