Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HES3Q5TGS1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms