Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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