Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXN3Q5MJ09 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms