Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms