Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms