Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms