Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms