Protein–RNA interactions for Protein: Q4W5G0

TIGD2, Tigger transposable element-derived protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD2Q4W5G0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TIGD2Q4W5G0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TIGD2Q4W5G0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TIGD2Q4W5G0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TIGD2Q4W5G0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TIGD2Q4W5G0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TIGD2Q4W5G0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TIGD2Q4W5G0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TIGD2Q4W5G0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TIGD2Q4W5G0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIGD2Q4W5G0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms