Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N7

FAM229B, Protein FAM229B, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM229BQ4G0N7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAM229BQ4G0N7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms