Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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