Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKPD1Q17RQ9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms