Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTPRNQ16849 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRNQ16849 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRNQ16849 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRNQ16849 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PTPRNQ16849 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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