Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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NRF1Q16656 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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NRF1Q16656 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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NRF1Q16656 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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NRF1Q16656 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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NRF1Q16656 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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NRF1Q16656 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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