Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms