Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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