Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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