Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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