Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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