Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
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