Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms