Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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