Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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