Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms