Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKD2Q13563 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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