Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP140Q13342 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP140Q13342 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP140Q13342 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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