Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 EMC8-206ENST00000600807 851 ntTSL 210.07□□□□□ -0.81e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AC090360.1-204ENST00000589713 444 ntTSL 29.12□□□□□ -0.951e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.131e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.341e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 NFE2L2-209ENST00000458603 455 ntTSL 36.16□□□□□ -1.421e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.812e-8■■■□□ 16.4
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PABPC4Q13310 CCDC86-202ENST00000535217 1488 ntTSL 519.78■□□□□ 0.762e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.142e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AL662899.3-203ENST00000409691 1903 ntTSL 316.25■□□□□ 0.191e-76■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 CCNG1-209ENST00000511490 418 ntTSL 518.82■□□□□ 0.64e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SPAG5-214ENST00000582076 719 ntTSL 317.13■□□□□ 0.332e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SPAG5-211ENST00000580676 1023 ntTSL 513.28□□□□□ -0.282e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SPAG5-215ENST00000582175 657 ntTSL 512.7□□□□□ -0.382e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SPAG5-208ENST00000580377 547 ntTSL 48.43□□□□□ -1.062e-8■■■□□ 16.4
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PABPC4Q13310 RPLP2-204ENST00000526222 350 ntTSL 213.55□□□□□ -0.241e-323■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 RPLP2-205ENST00000527517 646 ntTSL 213.19□□□□□ -0.31e-323■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AC135050.2-202ENST00000532364 499 ntTSL 426.11■■□□□ 1.772e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.382e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.052e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.952e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.92e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 VKORC1-206ENST00000420057 746 ntTSL 217.64■□□□□ 0.412e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AC135050.2-201ENST00000533518 2362 ntTSL 1 (best)17.05■□□□□ 0.322e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.285e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.385e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.125e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 INPPL1-203ENST00000535985 353 ntTSL 214.42□□□□□ -0.15e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.42e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.72e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MAN2C1-230ENST00000566099 1316 ntTSL 526.37■■□□□ 1.817e-9■■■□□ 16.4
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PABPC4Q13310 MAN2C1-205ENST00000562067 710 ntTSL 516.41■□□□□ 0.227e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.037e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.217e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MAN2C1-224ENST00000565683 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.247e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.37e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.167e-11■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.077e-11■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PRKAB1-202ENST00000537057 1510 nt13.63□□□□□ -0.237e-11■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PRKAB1-207ENST00000542698 4019 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.977e-11■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PARL-205ENST00000421484 1347 ntTSL 530.06■■■□□ 2.41e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PARL-213ENST00000639900 1545 ntTSL 528.7■■■□□ 2.191e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.111e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.861e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PARL-211ENST00000638817 1534 ntTSL 524.97■■□□□ 1.591e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.41e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.451e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PARL-212ENST00000639100 1513 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.691e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.991e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.132e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.452e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.22e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.684e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.192e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.642e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.642e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.71■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.452e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.752e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.261e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 TRMT2A-216ENST00000487668 1040 ntTSL 521.75■■□□□ 1.071e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 11e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 TRMT2A-206ENST00000444845 739 ntTSL 318.25■□□□□ 0.511e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.215e-51■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.045e-51■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 FAM96A-205ENST00000559705 636 ntTSL 314.8□□□□□ -0.045e-51■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.095e-51■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.315e-51■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.924e-9■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 SIRT7-210ENST00000572902 909 ntTSL 325.42■■□□□ 1.666e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 RHAG-202ENST00000371175 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-30■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.713e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.563e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MLEC-203ENST00000535413 617 ntTSL 212.34□□□□□ -0.433e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.682e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.377e-10■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AP000769.1-202ENST00000637877 646 ntTSL 515.88■□□□□ 0.134e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AP000769.1-201ENST00000619960 844 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.54e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AP000769.1-204ENST00000309775 800 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.634e-8■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 CDC34-205ENST00000606065 1062 ntTSL 527■■□□□ 1.914e-18■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 CDC34-206ENST00000606400 899 ntTSL 222.11■■□□□ 1.134e-18■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.921e-13■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 PSMD3-204ENST00000540504 458 ntTSL 320.41■□□□□ 0.861e-13■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MPG-204ENST00000436333 884 ntTSL 220.31■□□□□ 0.841e-6■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 AURKAIP1-205ENST00000489799 695 ntTSL 1 (best)28.59■■■□□ 2.172e-11■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.712e-7■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.483e-18■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MRPL40-202ENST00000443660 954 ntTSL 218.5■□□□□ 0.553e-18■■■□□ 16.4
PABPC4Q13310 MRPL40-203ENST00000471259 942 ntTSL 214.11□□□□□ -0.153e-18■■■□□ 16.4
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