Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SCGB2A2Q13296 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SCGB2A2Q13296 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SCGB2A2Q13296 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SCGB2A2Q13296 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SCGB2A2Q13296 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SCGB2A2Q13296 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SCGB2A2Q13296 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SCGB2A2Q13296 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SCGB2A2Q13296 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SCGB2A2Q13296 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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