Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms