Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX3Q13185 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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