Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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GPS1Q13098 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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