Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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TRAF1Q13077 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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TRAF1Q13077 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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TRAF1Q13077 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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