Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
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