Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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GRIK2Q13002 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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