Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms