Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIAQ12857 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIAQ12857 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
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