Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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