Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMAGPQ0VAQ4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms