Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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