Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms