Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOS1Q07889 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms