Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms