Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms