Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms